La direction de l’IMM a créé en 2014 une récompense annuelle intitulée le « coup de chapeau de l’IMM» pour mettre en avant le meilleur article publié de l’année par les équipes de  l’IMM, qui a le plus contribué à la renommée et à la visibilité de l’Institut de Microbiologie de la Méditerranée, dotée d’un prix de 1 000€ et d’une médaille.
Pour l’année 2016, le  
a été décernée le 13 janvier 2017 à  : L’équipe dirigée par ERIC CASCALES (LISM) pour ses travaux remarquables sur la structure et le fonctionnement du système de sécrétion de type 6, publiées dans un article de Nature (déjà cité 9 fois, F1000), mais aussi dans PNAS, Molecular Microbiology, J. Mol. Biol., et Scientific Reports.
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La Médaille : COSMOS par Renée Mayot. (Editée par la Monnaie de Paris)
L'artiste exprime dans cette œuvre, la vie, le mouvement, l'avenir à travers la recherche scientifique. Ici, l'Europe, la naissance de l'homme à partir du fœtus qui s'éveille à la vie, la notion du temps qui passe représentée par l'astrolabe et puis la connaissance qui se propage grâce à l'écriture.......
Remise du prix aux représentants de l’équipe : Laure Journet et Eric Durand
