Microscopie

La plateforme de Microscopie de l'IMM est un service accessible à l'ensemble de la communauté scientifique, comprenant deux volets : la Microscopie Optique et la Microscopie Électronique. Les projets menés au sein de cette plateforme proviennent des équipes de l'IMM, ainsi que d'autres équipes régionales et d'entreprises. Les systèmes biologiques étudiés sont principalement des bactéries, des virus, des virus géants, des amibes, des micro-algues, ainsi que des macromolécules etc...
Direction Scientifique : Dr James Sturgis.

Équipe Microscopie

Hugo Le Guenno IMM Marseille Assistants de prévention

Artemis KOSTA
Responsable Technique

Hugo LE GUENNO
Ingénieur

Artemis KOSTA
Responsable Technique

Contacter la plateforme

Les domaines d’expertise de la plateforme
Microscopie

Transmission Electron Microscopy - Plateforme Microscopie Institut de Microbiologie de la Méditerranée

Structured Illumination Microscopy - Plateforme Microscopie Institut de Microbiologie de la Méditerranée

Confocal Laser Scanning Microscopy - Plateforme Microscopie Institut de Microbiologie de la Méditerranée

Pictos CLEM plateforme Microscopie - Institut de Microscopie de la Méditerranée

Microscopie électronique (MET, Cryo-EM, MEB)

Microscopie de super-résolution (3D-SIM)

Microscopie confocale

Microscopie Corrélative (CLEM)

Microscopie électronique (MET, Cryo-EM, MEB)

Microscopie de super-résolution (3D-SIM)

Microscopie confocale

Microscopie Corrélative (CLEM)

Les offres de prestation de la plateforme
Microscopie

Image prestation Plateforme Microscopie - Institut de Microbiologie de la Méditerranée

Préparations d’échantillons

• Préparation conventionnelles : Fixation chimique, déshydratation, inclusion en résine, ultramicrotomie, contraste de coupes, contraste négatifs, Immunomarquage
• Cryo : cryo-fixation, cryo-substitution, cryo-ultramicrotomie, tokuyasu. vitrification

Service d’imagerie

• Cryo-EM, Cryo-Tomographie, TEM, Tomographie, CLEM, 3DSIM, TIRF, CLSM, WideField, Analyse d’images

Conseil et formations

• Formations individuelles sur les différentes techniques et instruments.
• Formations théoriques et pratiques (master, doctorats, ingénieurs, chercheurs): Cryo-EM, Optique, 3DSIM, Fiji...

Microscope électronique à transmission (FEI Tecnai G2 20 TWIN (200KV), LaB6, Gatan Oneview 4kx4k)
Microscope électronique à balayage (Tescan VEGA3 SBU, Low- Vacuum)
Microscope de super-résolution (3D SIM, 2D SIM, 2D SIM-TIRF, TIRF, Lasers 405, 488, 568, and 640 nm)
Confocal (Olympus FV1000, FLIM et FCS Pico Quant)
Epifluoresence (Microscope Axio Vert 200M)
Robot de vitrification (FEI Vitrobot Mark IV)
Congelateur de haute pression (HPF Leica HPM100)
Évaporateur, glow-discharge (Cressington 208c)
Porte-échantillons cryo (Gatan Elsa, 626)
Cryo ultramicrotome (UC7, chambre cryo FC7, cryosphere, camera/ecran Leica)

Réservations

La plateforme Microscopie en vidéos

Imagerie :

Analyse structurale :

Publications à la une

2025

Evolutionarily conserved grammar rules viral factories of amoeba-infecting members of the hyperdiverse Nucleocytoviricota phylum. Proc Natl Acad Sci U S A. 2025 Sep 2;122(35):e2515074122.

Rigou S, Schmitt A, Moreno AB, Lartigue A, Danner L, Mayer L, Giry C, Trabelsi F, Belmudes L, Olivero-Deibe N, Le Guenno H, Couté Y, Berois M, Legendre M, Jeudy S, Abergel C, Bisio H.

2025

CP12 controls ribulose 1,5-bisphosphate recycling and carbon acquisition in Chlamydomonas reinhardtii. BioRxiv. 2025.

Gérard C, Lebrun R, Verthuy C, Le Guenno H, Kosta A, Guérard F, Chang KS, Avilan L, Gakière B, Jin ES, Maberly SC, Gontero B, Launay H.

2025

Enderscope.py: A library for computational imaging using the EnderScope automated microscope. SoftwareX 2025; 31: 102210

Gharbi S, Poiraud E, Le Guenno H, Grandgirard E, Rousseau C, Burke N, Mutterer J, Rousseau D.

2025

Comparative analysis of transcriptomic profiles of mesenchymal stem cells at the onset of senescence and after exposure to acute exogenous oxidative stress. Biochem Biophys Res Commun 2025; 754: 151506.

Outskouni Z, Prapa S, Goutas A, Klagkou E, Vatsellas G, Kosta A, Trachana V, Papathanasiou I.

2025

Halophilic archaea produce wax esters and use an alternative fatty acyl-CoA reductase for precursor synthesis. ISME J 2025; Feb 24: wraf035.

Grossi V, Cuny P, Militon C, Witwinowski J, Eddhif B, Sylvi L, Nowakowski M, Kosta A, Antheaume I, Cornil J, Dubrac S, Kende J, Gribaldo S, Borrel G.

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