Protéomique

La plateforme protéomique de l'IMM propose des services en protéomique, protéomique quantitative, spectrométrie de masse et séquençage d’Edman dans les domaines de la microbiologie, de la biochimie et des biotechnologies. Nous sommes spécialisés dans la protéomique quantitative grâce à des technologies de pointe en spectrométrie de masse et en chromatographie liquide. Nos outils et notre expertise garantissent des données fiables et reproductibles même pour de très faibles quantités de matériel biologique. Nous offrons des solutions sur mesure pour accélérer vos projets de recherche, dans le respect des normes ISO 9001 -NFX 50-900.

Dès 1980, l’IMM a développé un Service de Microséquençage et d’analyses d’acides aminés sur le campus CNRS pour identifier et caractériser les protéines membranaires et solubles chez les microorganismes. La plateforme a été pionnière dans le domaine de la spectrométrie de masse biologique à Marseille et fut parmi les premières à obtenir le label RIO (Réseau Inter Organisme). Au début des années 2000, grâce à son leadership en recherche en protéomique, l’IMM est également devenu membre fondateur de Marseille-Nice-Génopole. En 2008, la plateforme protéomique de l’IMM est devenue une composante de "Marseille Protéomique" (MaP), labellisée IBiSA, incluant 2 autres sites de Marseille, le CRCM (IPC) et le MCT-PIT2 (La Timone), puis labellisée plateforme technologique d’Aix-Marseille Université, en 2013.

L'expertise de MaP-IMM couvre la recherche fondamentale sur les protéines de bactéries, virus, diatomées, algues, champignons et plantes pour étudier divers aspects tels que les activités enzymatiques, la croissance, les régulations énergétiques, l’adaptation au stress, la virulence, en lien avec les problématiques environnementales et sanitaires.

Direction Scientifique : Dr Olivier Genest.

Équipe Protéomique

Régine LEBRUN
Ingénieure de recherche
Responsable technique

Christophe VERTHUY
Ingénieur d’études

Maya BELGHAZI
Ingénieure de recherche

Équipe Protéomique

Régine LEBRUN
Ingénieure de recherche
Responsable technique

Christophe VERTHUY
Ingénieur d’études
Assistant de Prévention

Maya BELGHAZI
Ingénieure de recherche

Les domaines d’expertise de la plateforme
Protéomique

Identification de protéines par spectrométrie de masse

Protéomique
quantitative

Analyse de séquences protéiques par séquençage d’Edman

Mesure de masse de protéines entières

Les domaines d’expertise de la plateforme
Protéomique

Identification de protéines par spectrométrie de masse

Protéomique quantitative

Analyse de séquence protéique par séquençage d’Edman

Mesure de masse de protéines entières

Les offres de prestation de la plateforme
Protéomique

L’expertise de la plateforme protéomique de l’IMM est sollicitée à la fois sur des projets de R&D et des projets de prestations scientifiques

Bacterial Hsp90 chaperone: comprehensive identification of clients to reveal Hsp90 functional roles ANR Bact90ome ANR-20-CE44-0017- 02(2021-2025) Porteur du Projet: Olivier Genest (Bioénergétique et Ingénierie des Protéines, IMM, CNRS UMR7281, Aix-Marseille Université), Partenaire 2: Régine Lebrun, MaP-IMM CNRS FR3479, Aix-Marseille Université, Partenaire 3: JeanPhilipe Nougayrède, IRSD, INSERM, UMR 1220, Toulouse


OCEANIA: iOta Carbonic anhydrasE: A key respoNse to CO2 In diAtoms ANR “OCEANIA” ANR-21- CE20-0029- 03(2022-2025) Porteuses du Projet : Véronique Receveur-Brechot & Gontero Brigitte, Bioénergétique et Ingénierie des Protéines, BIP2 IMM, CNRS UMR7281, Aix-Marseille Université, Partenaire 2 : Mirjam Czjzek, LBIMM, UMR8227, Roscoff, partenaire 3 : Régine Lebrun, MaP-IMM, CNRS FR3479, Aix-Marseille Université

Target G4P : Identifying the targets and regulation of ppGpp signalling in plants ANR Target G4P22-CE20-0033 (2022-2026) Porteur du Projet : Ben Field, BIAM, CNRS UMR7283, Aix-Marseille Université, Partenaire2 : Boyuan Wang, UTSW Texas, Partenaire 3 : Etienne Maisonneuve, LCB, IMM, Aix-Marseille Université, Partenaire 4 : Régine Lebrun MaP-IMM, CNRS FR3479, Aix-Marseille Université

Prestations de service

• Identification des protéines (solubles ou membranaires) par LC-MS/MS formulaire de demande
• Analyses de protéomique quantitative formulaire de demande
• Séquençage N-terminal de protéines par la méthode d’Edman formulaire de demande
• Analyses de la masse des protéines intactes par MALDI-TOF ou ESI-Q-TOF formulaire de demande
• Caractérisation de modifications post-traductionnelles

Conseil et formations

La plateforme peut vous conseiller sur la mise en place des protocoles les plus adaptés pour répondre à une question biologique. Contactez-nous pour organiser une réunion de travail. La plateforme intervient régulièrement dans des programmes de formations universitaires et notamment dans le cursus de l’institut IM2B

Publications à la une

2024

Posttranslational regulation of photosynthetic activity via the TOR kinase in plants.

D'Alessandro S, Velay F, Lebrun R, Zafirov D, Mehrez M, Romand S, Saadouni R, Forzani C, Citerne S, Montané MH, Robaglia C, Menand B, Meyer C, Field B.

 

2024

Combining metabolic flux analysis with proteomics to shed light on the metabolic flexibility: the case
of Desulfovibrio vulgaris Hildenborough.

Marbehan X, Roger M, Fournier F, Infossi P, Guedon E, Delecourt L, Lebrun R, Giudici-Orticoni MT, Delaunay S.

 

 

2024

The downregulation of Kv1 channels in Lgi1-/-mice is accompanied by a profound modification of its interactome and a parallel decrease in Kv2 channels.

Ramirez-Franco J, Debreux K, Sangiardi M, Belghazi M, Kim Y, Lee SH, Lévêque C, Seagar M, El Far O.

2022

Gérard, C, Lebrun, R, Lemesle, E, Avilan, L, Chang, K.S, Jin, E, Carrière, F, Gontero, B, Launay, H.

Labels, certifications & réseaux connexes

Tarification CNRS : décision DR12 - 1er juillet 2024 - DEC247567DP12

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